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天壤测单蛋白结构技术评估排名全球第二

  人工智能企业天壤公司日前宣布,其自研的深度学习蛋白质折叠预测平台TRFold在基于CASP14(2020年第14届国际蛋白质结构预测竞赛)蛋白质测试集的评估中排名全球第二,仅次于AlphaFold2。在400个氨基酸的蛋白链预测时,TRFold仅耗时16秒。据了解,这是目前国内所有公开蛋白质结构预测模型中取得的最好成绩,标志着我国计算生物学领域的表现已经处于世界第一梯队。

  “我们通过两年半的时间掌握了蛋白质折叠核心技术,并以此参与到国际最前沿的生物医学领域的应用中,希望能够开辟出一条AI生物学的应用之路。”天壤公司创始人薛贵荣介绍,公司研发团队在两年半前开始进入计算生物学领域,天壤非常看好人工智能在生物领域的应用,尤其是AlphaFold2解决了单体蛋白质解构预测的问题,令天壤觉得人工智能会成为生物研发的基础设施,将开启一个广阔和巨大的市场,随着技术突破将重构许多原来的生物应用层面的逻辑,比如制药的流程、疾病的治疗、个性化医疗等等。

  据了解,天壤是提供通用人工智能的公司,主要应用在城市和企业数字化领域。从围棋到交通,再到如今的计算生物学领域,天壤的人工智能自研技术已具备很强的复杂系统的智能决策能力,旗下AI(人工智能)围棋TRGo、AI交通TRTraffic等技术都夯实了天壤的深度强化学习平台。

  “与之前相比,蛋白质结构预测是更复杂的领域,天壤本身的技术积累很适合解锁此类场景,所以进入这个领域是非常自然的选择。” 薛贵荣认为,不仅如此,这将为生命科学和医药领域带来益处,极大增进人类对细胞基本构成的理解,让药物研发加速升级,并将带来医疗保健、食品可持续性、新技术等方面的改善,进一步促进生物科学、药物研发、合成生物学方面的发展。

  “我们长期以来面临的都是此类复杂系统的决策问题,在技术层面已经有了深厚的积累。蛋白质折叠预测虽然是生物学课题,但也属于这个领域,并且体现了AI在基础科学中的巨大潜能,这也是每个立志于基础研发的AI从业者的价值取向,我们不愿意错过这道风景。”薛贵荣说。

  据天壤XLab研发团队负责人苗洪江介绍,目前,天壤蛋白质预测模型算法还在迭代优化。为了获得更佳的性能,TRFold在内存、训练数据、模型表达等方面做了许多创新和优化。目前的单个蛋白质折叠预测只是一个起点,接下来的工作重点将是利用目前的全蛋白质组协同进化分析,建立起蛋白质与蛋白质之间的相互作用的精准链路。